La primera parte está enfocada en métodos de ensamblaje híbridos, combinando diferentes tipos de secuencias, especialmente secuencias largas y cortas. En la segunda parte se trabajará en profundidad con los resultados de binning, para poder recuperar con gran precisión genomas muy completos a partir del metagenoma. Se enseña cómo depurar los bins, cómo completarlos, y cómo combinar resultados de diferentes métodos. La tercera y última parte se centra en el análisis estadístico de los resultados, usando R para obtener asociaciones entre abundancias de taxones/genes/rutas metabólicas y tipos de muestra, por ejemplo condiciones ambientales o parámetros clínicos.

Type of methodology: Combination of lecture and hands-on, Self learn

Participants receive the certificate of attendance: Yes

Paid training activity for participants: Yes, for all

Participants prerequisite knowledge: HPC tools (e.g. profiler, scheduler)