Curso Práctico Avanzado del uso de la Supercomputación aplicado a la Metagenómica y Genómica comparada

Service scope
Este curso está destinado a profundizar en los métodos de análisis metagenómico para sacar todo el partido posible de las secuencias.
Service description

La primera parte está enfocada en métodos de ensamblaje híbridos, combinando diferentes tipos de secuencias, especialmente secuencias largas y cortas. En la segunda parte se trabajará en profundidad con los resultados de binning, para poder recuperar con gran precisión genomas muy completos a partir del metagenoma. Se enseña cómo depurar los bins, cómo completarlos, y cómo combinar resultados de diferentes métodos. La tercera y última parte se centra en el análisis estadístico de los resultados, usando R para obtener asociaciones entre abundancias de taxones/genes/rutas metabólicas y tipos de muestra, por ejemplo condiciones ambientales o parámetros clínicos.

Type of methodology: Combination of lecture and hands-on, Self learn

Participants receive the certificate of attendance: Yes

Paid training activity for participants: Yes, for all

Participants prerequisite knowledge: HPC tools (e.g. profiler, scheduler)

Level
Potential users
Beginner
Intermediate
Advanced
Scientific Domain
Biochemistry, Bioinformatics and Life sciences
Chemical Sciences and Materials
Engineering
Category
Training events
Service Start
Service End
Service valid until
Audience
Research and Academia
Industry
Provider
Location category
Language
Spanish
Technical Domain
Data science and high performance data analytics
HPC
Format
In person
Initiative
Castiel and EuroCC
Country